慢性酒精摄入后小胶质细胞特异性转录组变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE91387

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数据说明

小胶质细胞是中枢神经系统(CNS)内至关重要的免疫细胞，它们对环境挑战作出响应以维持正常的生理过程。稳态细胞功能的改变和小胶质细胞的过度激活可促进阿尔茨海默病、多发性硬化症和重度抑郁症等神经病理状况的发生和进展。饮酒会破坏对CNS稳态至关重要的信号通路，包括先天性和适应性免疫应答。研究采用无偏RNA-Seq分析来识别分离的小胶质细胞在反复自愿饮酒行为中基因表达的变化。基因共表达分析识别出一组小胶质细胞特有的协调调控基因，这些基因总体上与饮酒相关。该组中的若干基因参与toll样受体信号传导和炎性细胞因子干扰素-γ的产生。

这些基因的协同表达无法从中枢神经系统细胞类型的混合物中确定，这凸显了检查分离细胞群体以揭示由成熟小胶质细胞引起的系统性基因表达变化的重要性。我们鉴定出一种与酒精消费相关的神经免疫反应所特有的小胶质细胞基因表达特征，这为深入了解物质滥用发展及相关中枢神经系统疾病背后小胶质细胞特异性变化提供了宝贵见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。