血浆microRNA生物标志物检测轻度认知障碍的差异相关分析数据集
该数据集来自NCBI,包含日本30例年龄匹配对照与23例轻度认知障碍(MCI)患者的血浆样本,检测745个microRNA(miRNA)的表达

基本信息
资源简介
血浆microRNA生物标志物检测轻度认知障碍的差异相关分析数据集
Plasma microRNA biomarker detection for mild cognitive impairment using differential correlation analysis
该数据集来自NCBI,包含日本30例年龄匹配对照与23例轻度认知障碍(MCI)患者的血浆样本,检测745个microRNA(miRNA)的表达。研究采用差异相关分析,识别病例与对照间两个变量相关性的差异,最终筛选出由20个miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物,其中两对为hsa-miR-191与hsa-miR-101、hsa-miR-103与hsa-miR-222。数据可用于MCI早期检测的血浆miRNA生物标志物研究,以及基于分子间相互作用的分类建模(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 02 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:轻度认知障碍(MCI)是正常衰老与阿尔茨海默病及其他痴呆之间的中间状态。痴呆和MCI的早期检测在二级预防方面是一个关键问题。血液生物标志物检测是早期检测MCI的一种可能途径。尽管疾病生物标志物通常通过单分子分析(如t检验)检测,但另一种可能的方法是基于分子间的相互作用。结果:对来自日本30例年龄匹配对照和23例MCI患者血浆样本的745个microRNA(miRNA)数据集进行了差异相关分析,该分析检测病例/对照研究中两个变量相关性的差异。选取了由20个miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物。两对miRNA(hsa-miR-191和hsa-miR-101,以及hsa-miR-103和hsa-miR-222)o
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by RT-PCR、GPL22741、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE90828
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 30 201,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:轻度认知障碍(MCI)是正常衰老与阿尔茨海默病及其他痴呆症之间的中间状态。早期发现痴呆和MCI,对于二级预防而言是一个至关重要的问题。血液生物标志物检测是早期发现MCI的一种可能途径。尽管疾病生物标志物通常通过单一分子分析(如t检验)来检测,但另一种可能的方法是基于分子间的相互作用。结果:对日本30名年龄匹配的对照组和23名MCI患者血浆样本中的745种微小RNA(miRNA)数据集进行了差异相关分析,该分析用于检测病例/对照研究中两个变量相关性的差异。筛选出由20种miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物。其中两对miRNA(hsa-miR-191与hsa-miR-101,以及hsa-miR-103与hsa-miR-222)在MCI检测中达到了最高的曲线下面积(AUC)值0.962。另外两对包含hsa-miR-191和hsa-miR-125b的miRNA对也达到了≥0.95的高AUC值。为进一步理解其生物学意义,对MCI标志物进行了通路分析。
因此,hsa-miR-191相关性的崩溃和hsa-miR-125b相关性的出现可能在MCI和痴呆进展中发挥关键作用。结论:差异相关分析作为一种生物信息学工具,能够阐明疾病背后复杂且相互依赖的生物系统,检测出单分子分析(如t检验)无法发现的有效MCI标志物。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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