血浆microRNA生物标志物检测轻度认知障碍的差异相关分析数据集

该数据集来自NCBI,包含日本30例年龄匹配对照与23例轻度认知障碍(MCI)患者的血浆样本,检测745个microRNA(miRNA)的表达

geo
浏览 10
其他分类Expression profiling by RT-PCRGPL227419606
GSE90828: Plasma microRNA biomarker detection for mild cognitive impairment using differential correlation analysis

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

血浆microRNA生物标志物检测轻度认知障碍的差异相关分析数据集

Plasma microRNA biomarker detection for mild cognitive impairment using differential correlation analysis

该数据集来自NCBI,包含日本30例年龄匹配对照与23例轻度认知障碍(MCI)患者的血浆样本,检测745个microRNA(miRNA)的表达。研究采用差异相关分析,识别病例与对照间两个变量相关性的差异,最终筛选出由20个miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物,其中两对为hsa-miR-191与hsa-miR-101、hsa-miR-103与hsa-miR-222。数据可用于MCI早期检测的血浆miRNA生物标志物研究,以及基于分子间相互作用的分类建模(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 02 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:轻度认知障碍(MCI)是正常衰老与阿尔茨海默病及其他痴呆之间的中间状态。痴呆和MCI的早期检测在二级预防方面是一个关键问题。血液生物标志物检测是早期检测MCI的一种可能途径。尽管疾病生物标志物通常通过单分子分析(如t检验)检测,但另一种可能的方法是基于分子间的相互作用。结果:对来自日本30例年龄匹配对照和23例MCI患者血浆样本的745个microRNA(miRNA)数据集进行了差异相关分析,该分析检测病例/对照研究中两个变量相关性的差异。选取了由20个miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物。两对miRNA(hsa-miR-191和hsa-miR-101,以及hsa-miR-103和hsa-miR-222)o

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by RT-PCR、GPL22741、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE90828

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 30 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE90828

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:轻度认知障碍(MCI)是正常衰老与阿尔茨海默病及其他痴呆症之间的中间状态。早期发现痴呆和MCI,对于二级预防而言是一个至关重要的问题。血液生物标志物检测是早期发现MCI的一种可能途径。尽管疾病生物标志物通常通过单一分子分析(如t检验)来检测,但另一种可能的方法是基于分子间的相互作用。结果:对日本30名年龄匹配的对照组和23名MCI患者血浆样本中的745种微小RNA(miRNA)数据集进行了差异相关分析,该分析用于检测病例/对照研究中两个变量相关性的差异。筛选出由20种miRNA组成的20对miRNA作为MCI标志物。其中两对miRNA(hsa-miR-191与hsa-miR-101,以及hsa-miR-103与hsa-miR-222)在MCI检测中达到了最高的曲线下面积(AUC)值0.962。另外两对包含hsa-miR-191和hsa-miR-125b的miRNA对也达到了≥0.95的高AUC值。为进一步理解其生物学意义,对MCI标志物进行了通路分析。

因此,hsa-miR-191相关性的崩溃和hsa-miR-125b相关性的出现可能在MCI和痴呆进展中发挥关键作用。结论:差异相关分析作为一种生物信息学工具,能够阐明疾病背后复杂且相互依赖的生物系统,检测出单分子分析(如t检验)无法发现的有效MCI标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案