GSE48350:阿尔茨海默病数据集

该数据集为来自 NCBI 的阿尔茨海默病微阵列表达谱数据,包含正常对照(20-99 岁)与阿尔茨海默病病例样本,覆盖海马、内嗅皮层、额上回皮层、中央后回四个脑区

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE48350: Alzheimer's Disease Dataset

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

GSE48350:阿尔茨海默病数据集

GSE48350 阿尔茨海默病数据集来源于 NCBI,属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类下的基因表达谱数据。该数据集包含正常对照(年龄覆盖 20 至 99 岁)与阿尔茨海默病病例的微阵列数据,样本取自四个脑区:海马、内嗅皮层、额上回皮层和中央后回。研究分析了突触相关基因和免疫相关基因的表达变化,考察与年龄相关的变化、与阿尔茨海默病相关的变化,以及不同脑区特有的变化模式。数据集以 GZIP 压缩格式提供,文件数量为 1,样例文件名为 GSE48350_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL570 和 9606,作者为 N,C,Berchtold,发布时间为 Jun 27 201。

【数据集背景】

该数据集聚焦阿尔茨海默病这一神经系统疾病,旨在通过微阵列表达谱分析,比较正常对照与阿尔茨海默病病例之间的基因表达差异。源站描述指出,研究覆盖正常对照(20 至 99 岁)和阿尔茨海默病病例,并选取了四个脑区进行观察:海马、内嗅皮层、额上回皮层和中央后回。研究关注突触相关基因和免疫相关基因的表达变化,同时分析年龄相关变化、阿尔茨海默病相关变化以及区域特异性的变化模式。这一设计有助于从转录组层面理解阿尔茨海默病在不同脑区中的分子特征,以及年龄因素在其中的作用。

【数据内容】

数据集包含微阵列表达谱数据,样本类型包括正常对照和阿尔茨海默病病例。正常对照的年龄范围为 20 至 99 岁。数据覆盖四个脑区:海马、内嗅皮层、额上回皮层和中央后回。分析重点为突触相关基因和免疫相关基因的表达变化,并考察年龄相关变化、阿尔茨海默病相关变化以及区域特异性变化模式。数据集文件数量为 1,样例文件为 GSE48350_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL570 和 9606。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站标题为 Alzheimer's Disease Dataset,数据集英文名为 GSE48350: Alzheimer's Disease Dataset。作者为 N,C,Berchtold,发布时间为 Jun 27 201。主题标签显示其属于 Expression profiling by array,涉及 GPL570 平台和 9606 物种标识。本站分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。

【适用场景】

该数据集适用于阿尔茨海默病相关的基因表达研究,尤其是针对突触相关基因和免疫相关基因的分析。由于覆盖正常对照(20 至 99 岁)与阿尔茨海默病病例,并包含四个脑区,可用于比较不同脑区之间的表达差异,分析年龄相关变化与疾病相关变化,以及探索区域特异性的变化模式。主题标签表明其属于微阵列表达谱数据,适合用于表达谱层面的探索性分析。具体应用方向需结合源站描述和研究目的确定,源站未提供更详细的适用场景说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE48350_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按相应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。源站未提供其他具体的使用步骤或分析流程。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本量、技术重复、批次效应或缺失值等方面的具体说明。数据集文件数量为 1,样例文件为 GSE48350_series_matrix.txt.gz。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

作者为 N,C,Berchtold。发布时间为 Jun 27 201。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。许可信息源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48350

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自正常对照组(年龄20-99岁)和阿尔茨海默病病例的微阵列数据,涉及4个脑区:海马体、内嗅皮层、上额皮层、中央后回。分析了突触和免疫相关基因表达的变化,探究了与年龄相关的变化、与AD相关的变化以及区域特异性的变化模式。这些AD病例与GSE11882中包含的对照组病例(年轻和老年)同时处理(GSE11882数据集仅包含正常对照大脑的数据)。

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