牙周炎与糖尿病对阿尔茨海默病小鼠模型关联评估 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344050

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数据说明

本研究旨在利用阿尔茨海默病（AD）模型小鼠，通过微小RNA（miRNA）探讨牙周炎与糖尿病（DM）和AD相关变化之间的关联。将24只雄性基因敲入小鼠（B6-AppNL-G-F/NL-G-F/J）分为四组：对照组（C）、糖尿病组（DM）、牙周炎组（P）和糖尿病合并牙周炎组（DM+P）。经过8周的实验期后，采用Y迷宫试验评估记忆表现，并通过下一代测序分析脑样本。通过比较DM+P组和C组评估miRNA和mRNA表达谱，并进行miRNA–mRNA整合分析以确定候选调控关系。同时还评估了海马区Neurod1蛋白的表达。DM+P组的记忆表现显著低于C组。整合分析确定了7对候选miRNA–mRNA配对，其中Neurod1的mRNA表达下降最为显著，并预测其受miR-693-3p调控。DM+P组海马区Neurod1蛋白表达显著低于C组。

这些发现表明，牙周炎与糖尿病的联合暴露与阿尔茨海默病样病理改变及miRNA–mRNA调控关系的改变相关，其中miR-693-3p/Neurod1配对被确定为候选调控轴。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。