阿尔茨海默病细胞类型特异性组蛋白乙酰化图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE341557

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病（AD）的特征是异常的淀粉样蛋白β和tau聚集、神经炎症、脱髓鞘和神经退行性变，这些均与细胞特异性基因表达特征的变化相关。在驱动细胞类型特异性转录变化的机制中，组蛋白乙酰化在调控基因活性方面发挥核心作用。尽管组蛋白乙酰化的整体改变已被认为与AD有关，但各细胞类型对这些表观遗传变化的贡献仍知之甚少。为解析AD发病过程中基因调控的细胞类型特异性变化，我们对晚期AD患者和非痴呆对照者前额叶皮层中小胶质细胞、少突胶质细胞和神经元的组蛋白H3赖氨酸27乙酰化（H3K27ac）进行了分析。在AD中，少突胶质细胞具有最多数量的差异H3K27ac区域，其次是小胶质细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。