GSE335667：预测阿尔茨海默病中小胶质细胞相关细胞间通讯通路：SPP1的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335667

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小胶质细胞在阿尔茨海默病（AD）的病理生理学中起着关键作用，其异质性的增加可能影响疾病进展。我们此前鉴定出在AD供体中富集并分别与淀粉样蛋白和tau蛋白相关的不同小胶质细胞特征。在此，我们分析了可能与AD病理生理学相关的细胞间通讯通路。我们从死后对照和AD病例中生成了snRNAseq数据集，并分析了细胞间通讯的改变。在AD病例中受到扰动的一条信号通路涉及SPP1，虽然该通路也存在于对照样本中，但小胶质细胞-小胶质细胞SPP1信号传导仅限于AD供体。对小胶质细胞-小胶质细胞信号传导的进一步分析预测了AD特异性的GAS6-AXL信号传导（来自炎症性和核糖体小胶质细胞）以及SPP1-ITGAV/ITGB5信号传导（来自疾病相关和炎症性小胶质细胞等）的诱导。总之，这些发现可能部分解释了AD中所描述的小胶质细胞吞噬特征增强。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。