阿尔茨海默病脑血管系统线粒体钙异质性数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE334775),聚焦阿尔茨海默病中脑血管系统的线粒体钙异质性。研究对稳定表达家族性 AD 相关 APP 突变(APPswe/F/L)的人脑来源永生化血管周细胞(HBVP)和血管平滑肌细胞(HBVSMC)进行转录组表达谱分析,并与野生型细胞对照,覆盖 HBVP-W

geo
浏览 7
基因组分类GPL342849606
GSE334775: Mitochondrial calcium heterogeneity in the cerebrovascular system during Alzheimer's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

阿尔茨海默病脑血管系统线粒体钙异质性数据集

Mitochondrial calcium heterogeneity in the cerebrovascular system during Alzheimer's disease

该数据集来自 NCBI GEO(GSE334775),聚焦阿尔茨海默病中脑血管系统的线粒体钙异质性。研究对稳定表达家族性 AD 相关 APP 突变(APPswe/F/L)的人脑来源永生化血管周细胞(HBVP)和血管平滑肌细胞(HBVSMC)进行转录组表达谱分析,并与野生型细胞对照,覆盖 HBVP-WT、HBVP-APPswe/F/L、HBVSMC-WT、HBVSMC-APPswe/F/L 四类样本。数据可用于研究 AD 相关细胞应激反应的转录特征,以及脑血管壁细胞在 AD 中的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):神经元机制一直是阿尔茨海默病(AD)研究的核心,但脑血管细胞的贡献仍表征不足。本研究纳入人脑来源永生化血管周细胞(HBVP)和血管平滑肌细胞(HBVSMC),它们在神经血管耦合和维持血脑屏障完整性中发挥作用。人脑血管周细胞(HBVP)和人脑血管平滑肌细胞(HBVSMC)被工程化改造以稳定表达家族性 AD 相关 APP 突变(APPswe/F/L)。为模拟 AD 相关细胞状态,对野生型细胞和表达淀粉样前体蛋白(APPswe/F/L)的细胞在两种壁细胞类型(HBVP-WT、-APPswe/F/L 和 HBVSMC-WT、-APPswe/F/L)中进行了转录组分析。生成基因表达数据集以捕获与细胞应激反应相关的转录特征

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334775

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 06 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334775

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经元机制一直是阿尔茨海默病(AD)研究的核心,然而脑血管细胞的贡献仍未被充分阐明。本研究纳入了人脑来源的永生化血管周细胞(HBVP)和血管平滑肌细胞(HBVSMC),二者在神经血管耦合及维持血脑屏障完整性中发挥作用。研究对人脑血管周细胞(HBVP)和人脑血管平滑肌细胞(HBVSMC)进行工程化改造,使其稳定表达与家族性AD相关的APP突变(APPswe/F/L)。为模拟AD相关的细胞状态,对野生型细胞及表达淀粉样前体蛋白(APPswe/F/L)的细胞在两种壁细胞类型(HBVP-WT、-APPswe/F/L及HBVSMC-WT、-APPswe/F/L)中进行了转录组分析。所生成的基因表达数据集捕获了与细胞应激反应、代谢、信号传导及细胞存活相关的转录特征。

特别关注与线粒体钙处理相关的基因和通路,以及更广泛的钙信号传导过程,包括离子通道和细胞内钙调节机制,以便在不同血管细胞类型之间进行比较。这些数据为进一步分析阿尔茨海默病相关条件下人脑血管细胞中线粒体钙相关基因表达和细胞类型特异性转录程序提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案