信号受体内体回收受损激活细胞外UPR

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334451

标准获取流程：

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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

线粒体功能障碍和细胞外蛋白聚集出现在阿尔茨海默病（AD）等神经退行性疾病中。然而，这些过程是否在功能上相互关联仍不清楚。在此，我们鉴定出一条在细胞外空间易聚集蛋白积累时被激活的信号通路。我们发现，调控线粒体未折叠蛋白反应的转录因子ATFS-1，也调控内体循环所需的转录本、多种质膜定位的信号受体，以及结合细胞外空间易聚集蛋白并促进其降解的分泌蛋白，包括运甲状腺素蛋白和Aβ。有趣的是，Aβ(1-42)聚集通过促进bZIP蛋白ZIP-3的降解来诱导atfs-1依赖性转录，而ZIP-3拮抗ATFS-1。当ZIP-3被质膜定位信号受体（包括WNT和谷氨酸受体）下游发挥作用的激酶磷酸化时，ZIP-3在胞质中积累。

配体结合后，信号受体激活同源激酶，我们发现其中许多激酶可磷酸化ZIP-3，阻碍ZIP-3降解，使其能够拮抗atfs-1依赖性转录。然而，易聚集蛋白（如Aβ(1–42)）的积累会导致内体肿胀，损害内体循环，转而将信号受体分流至溶酶体进行降解。进而，信号受体的耗竭降低了ZIP-3磷酸化水平，导致ZIP-3降解并激活atfs-1依赖性转录，从而促进细胞外蛋白质稳态。与ATFS-1类似，哺乳动物同源物ATF4和ATF5调控与内体组分、内体循环及细胞外伴侣相关的基因，提示缓解细胞外蛋白质聚集的机制在进化上具有保守性。我们的发现揭示了内吞质量控制之间一种意想不到的耦合

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。