阿尔茨海默病骨髓髓系造血功能障碍数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE329430),利用单细胞 RNA 测序分析阿尔茨海默病小鼠模型对骨髓造血的影响。数据覆盖 WT 与 5xFAD 小鼠骨髓中的髓系细胞和造血干祖细胞、脑内髓系细胞,以及接受 WT 或 IFNAR1-KO 供体骨髓移植的 5xFAD 嵌合小鼠分选髓系细胞

基本信息
资源简介
阿尔茨海默病骨髓髓系造血功能障碍数据集
Bone marrow myelopoiesis dysfunction in Alzheimer’s disease
该数据集来自 NCBI GEO(GSE329430),利用单细胞 RNA 测序分析阿尔茨海默病小鼠模型对骨髓造血的影响。数据覆盖 WT 与 5xFAD 小鼠骨髓中的髓系细胞和造血干祖细胞、脑内髓系细胞,以及接受 WT 或 IFNAR1-KO 供体骨髓移植的 5xFAD 嵌合小鼠分选髓系细胞。可用于在单细胞水平比较基因表达差异、识别细胞类型与状态,研究阿尔茨海默病中骨髓髓系造血功能障碍及干扰素信号相关机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们利用单细胞 RNA 测序,在单细胞水平分析阿尔茨海默病小鼠模型如何影响骨髓造血。我们分选并分析了 WT 和 5xFAD 小鼠骨髓中的髓系细胞与造血干祖细胞,以及脑内的髓系细胞。我们还分析了 5xFAD 嵌合小鼠的分选髓系细胞,这些小鼠接受了来自 WT 或 IFNAR1-KO 供体的骨髓移植。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329430
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 10 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329430
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们利用单细胞RNA测序技术,在单细胞水平上分析了阿尔茨海默病小鼠模型如何影响骨髓造血。我们从野生型(WT)和5xFAD小鼠的骨髓中分选并分析了髓系细胞及造血干/祖细胞,同时分析了这些小鼠大脑中的髓系细胞。我们还分析了5xFAD嵌合小鼠中分选的髓系细胞,这些小鼠接受了来自WT或IFNAR1-KO供体的骨髓移植。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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