GSE327711:GPR34对iMGL中疾病相关小胶质细胞状态的调控
该数据集来自NCBI GEO,聚焦GPR34对疾病相关小胶质细胞(DAM)状态的调控,涉及阿尔茨海默病等神经疾病背景。研究涵盖Gpr34敲除小鼠与5xFAD AD模型小鼠的转录组比较,以及人干细胞来源小胶质细胞(iMGL)中GPR34敲除的效应,可用于分析小胶质细胞疾病相关状态与炎症特征的转录变化(

基本信息
资源简介
GSE327711:GPR34对iMGL中疾病相关小胶质细胞状态的调控
GPR34 regulation of disease-associated microglial states in iMGL
该数据集来自NCBI GEO,聚焦GPR34对疾病相关小胶质细胞(DAM)状态的调控,涉及阿尔茨海默病等神经疾病背景。数据包含1个文件(GSE327711_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序的表达谱数据,物种为人(9606),平台为GPL34281。研究涵盖Gpr34敲除小鼠与5xFAD AD模型小鼠的转录组比较,以及人干细胞来源小胶质细胞(iMGL)中GPR34敲除的效应,可用于分析小胶质细胞疾病相关状态与炎症特征的转录变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):GPR34是一种富含于小胶质细胞的GPCR,其在多种疾病条件下表达下调,包括阿尔茨海默病(AD)和多发性硬化(MS)。尽管如此,其在正常或疾病条件下的功能以及其对疾病相关小胶质细胞状态的贡献仍知之甚少。利用RNA测序,我们发现来自全身性Gpr34敲除(KO)小鼠大脑的小胶质细胞表现出向疾病相关小胶质细胞(DAM)和炎症特征的转录转变,部分反映了在5xFAD AD模型小鼠中观察到的小胶质细胞表型。值得注意的是,当Gpr34 KO小鼠与5xFAD小鼠杂交时,尽管淀粉样变性已驱动了强烈的DAM特征,DAM转录谱和胶质病理仍进一步加剧。这一现象未影响淀粉样斑块负荷。在人干细胞来源的小胶质细胞(iMGLs)中,GPR34 KO强烈降低了cal
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34281、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327711
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
GPR34是一种富含于小胶质细胞的G蛋白偶联受体(GPCR),其在多种疾病状态下表达下调,包括阿尔茨海默病(AD)和多发性硬化症(MS)。尽管如此,人们对其在正常或疾病状态下的功能知之甚少,对其在疾病相关小胶质细胞状态中的贡献也了解有限。利用RNA测序技术,我们发现来自全身性Gpr34基因敲除(KO)小鼠脑内的小胶质细胞表现出向疾病相关小胶质细胞(DAM)和炎症性转录谱的转变,部分再现了5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠中所见的小胶质细胞表型。值得注意的是,当将Gpr34 KO小鼠与5xFAD小鼠杂交时,尽管淀粉样变性已驱动了强烈的DAM特征,DAM转录谱和胶质病理仍进一步加剧。这一现象的发生并未影响淀粉样斑块负荷。在人干细胞衍生的小胶质细胞(iMGLs)中,GPR34 KO显著降低了对已知GPR34激动剂(包括溶血磷脂酰丝氨酸(lysoPS)和髓鞘)的钙(Ca²⁺)和磷酸化ERK(pERK)信号响应,并引起了与免疫调节和细胞增殖相关的转录改变。
有趣的是,GPR34缺失选择性地损害了对髓鞘的吞噬作用,但不影响对淀粉样蛋白-β或大肠杆菌的吞噬。此外,GPR34敲除减弱了由髓鞘引发的转录反应,但并未完全消除该反应。综上所述,这些发现表明GPR34对于维持小胶质细胞稳态、介导对髓鞘的吞噬作用及转录反应,以及限制小胶质细胞对神经退行性疾病状况的反应具有重要意义。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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