KAT7表观遗传调控小胶质细胞线粒体免疫驱动阿尔茨海默病发病机制 [RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 KAT7 表观遗传调控小胶质细胞线粒体免疫驱动阿尔茨海默病发病机制 [RNA-Seq],属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,包含 1 个文件 GSE327604_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱技术,物种为小鼠(GPL24247,
![GSE327604: Epigenetic control of microglial mitochondrial immunity by KAT7 drives Alzheimer’s disease pathogenesis [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/146793.jpg)
基本信息
资源简介
KAT7表观遗传调控小胶质细胞线粒体免疫驱动阿尔茨海默病发病机制 [RNA-Seq]
Epigenetic control of microglial mitochondrial immunity by KAT7 drives Alzheimer’s disease pathogenesis [RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 KAT7 表观遗传调控小胶质细胞线粒体免疫驱动阿尔茨海默病发病机制 [RNA-Seq],属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,包含 1 个文件 GSE327604_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱技术,物种为小鼠(GPL24247,10090)。数据可用于研究 KAT7 通过表观遗传机制调控小胶质细胞线粒体免疫及 mtDNA 释放、cGAS-STING 和 NLRP3 信号通路在阿尔茨海默病中的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):线粒体 DNA(mtDNA)驱动的先天免疫信号维持阿尔茨海默病(AD)等神经系统疾病中的慢性神经炎症,但该通路在小胶质细胞中如何被调控仍知之甚少。在此,我们确定组蛋白乙酰转移酶 KAT7(HBO1)是将染色质重塑与线粒体免疫激活联系起来的核心表观遗传调控因子。KAT7 及其组蛋白标记 H3K14ac 在 5×FAD 小鼠和人类 AD 脑的小胶质细胞中升高。整合转录组和表观基因组分析揭示,KAT7 激活 Cmpk2 的转录,Cmpk2 是 mtDNA 合成所必需的线粒体激酶。KAT7 缺失降低 Cmpk2 表达,损害 mtDNA 复制和释放,并因此抑制 cGAS-STING 和 NLRP3 信号传导。重要的是,小胶质细胞特异性缺失和 KAT7 的药理抑制均减轻胞质 mtDNA 诱导的神经
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327604
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 15 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
线粒体DNA(mtDNA)驱动的先天免疫信号传导维持着阿尔茨海默病(AD)等神经系统疾病中的慢性神经炎症,然而该通路在小胶质细胞中如何被调控仍知之甚少。在此,我们鉴定出组蛋白乙酰转移酶KAT7(HBO1)作为连接染色质重塑与线粒体免疫激活的核心表观遗传调控因子。KAT7及其组蛋白标记H3K14ac在5×FAD小鼠和人类AD脑组织的小胶质细胞中升高。整合转录组与表观基因组分析揭示,KAT7激活Cmpk2的转录,后者是mtDNA合成所必需的线粒体激酶。KAT7缺失降低Cmpk2表达,损害mtDNA复制与释放,进而抑制cGAS-STING和NLRP3信号传导。重要的是,小胶质细胞特异性敲除和药理学抑制KAT7均能减轻胞质mtDNA诱导的神经炎症,减少淀粉样蛋白β负荷,恢复突触可塑性,并改善5×FAD小鼠的认知功能。总之,这些发现揭示了一条维持小胶质细胞致病性的表观遗传-线粒体轴,并确立KAT7作为AD的有前景的治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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