蓝斑黑色素皮质素通路基因细胞特征snRNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327442

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肥胖与阿尔茨海默病（AD）在流行病学上存在关联。蓝斑（LC）——大脑中去甲肾上腺素的主要且最重要的来源——是AD中最早发生神经退行的部位之一。LC通过与下丘脑的连接参与摄食行为。LC的细胞组成已在单细胞分辨率上得到表征。然而，与能量稳态相关的基因——如黑素皮质素通路基因——在LC中的组成性细胞特征尚不清楚。我们在人LC中进行了单核RNA测序和空间转录组学（Visium），并在小鼠LC中进行了HiPlex RNAscope。黑素皮质素通路基因MRAP2在整个LC的大多数DBH神经元中表达。Mrap2还与AD相关基因如App、Psen1、Psen2和Sorl1共表达。LC中超过20%的Dbh神经元对Mrap2、App、Psen1和Psen2呈阳性。Mrap2在中枢神经系统中表达，并调节黑素皮质素受体家族全部五种G蛋白偶联受体（GPCRs）的转运和信号传导：Mc1r、Mc2r、Mc3r、Mc4r和Mc5r。

在小鼠中，在黑色素皮质素受体中，Mc5r与Mrap2的共表达最高，占Mrap2阳性细胞的17.9%，其次是Mc2r，占Mrap2阳性细胞的10.9%。Mc1r、Mc3r和Mc4r与Mrap2的共表达非常有限。我们的研究揭示，许多Mrap2阳性细胞不表达任何黑色素皮质素受体基因，这值得未来研究LC中MRAP2下游与代谢相关的GPCR。总之，我们的研究表征了人类和小鼠LC中的黑色素皮质素分子底物，并强调MRAP2是能量稳态通路与神经退行性变通路之间的潜在联系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。