脑血管单核RNA测序揭示阿尔茨海默病与原发性tau蛋白病的热休克激活与血管重塑

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327289

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑血管功能障碍促进阿尔茨海默病（AD）和原发性tau蛋白病的疾病进展，然而血管细胞群体内的分子改变仍知之甚少。我们对死后人颞下回进行了单核RNA测序，以表征AD和原发性tau蛋白病（包括皮质基底节变性、皮克病和进行性核上性麻痹）中各类脑血管细胞类型的转录组变化。差异表达分析显示，血管细胞群体中主要呈现疾病特异性的转录程序。然而，参与热休克反应的基因在所有疾病中均持续上调，提示神经退行性变过程中存在保守的脑血管应激反应。我们还报告了与原发性tau蛋白病相比，AD中发生了广泛的脑血管重塑，并发现AD全基因组关联研究（GWAS）位点内的基因在脑血管相关细胞中存在失调。转录组学发现通过组织透明化、光片显微镜和血管标志物的免疫荧光定量进行了验证。

我们强调了神经退行性变中共享的和疾病特异性的血管机制，这些机制具有重新定义靶向治疗的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。