散发性阿尔茨海默病患者来源星形胶质细胞的转录组与表型数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319380

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

星形胶质细胞是中枢神经系统稳态的重要调节者，并积极参与神经退行性疾病的进展，包括阿尔茨海默病（AD）。虽然家族性AD（fAD）已与明确的基因突变相关联，但散发性AD（sAD）——这种占主导地位且更具异质性的形式——缺乏明确的致病机制。人类诱导多能干细胞（hiPSCs）提供了一个强大的平台，通过在受控条件下生成患者特异性的神经细胞类型来模拟sAD。在本数据集中，我们展示了来自临床诊断为sAD的个体和年龄匹配的健康对照者的hiPSC衍生星形胶质细胞的详细表征。细胞暴露于聚集的淀粉样蛋白-β（Aβ）或过氧化氢（H₂O₂），以模拟与蛋白质毒性和氧化损伤相关的疾病相关应激源。我们报告了（1）通过bulk RNA测序评估的全基因组转录反应，（2）作为炎症激活标志物的IL-6细胞因子分泌，以及（3）表型结果，包括形态学改变和细胞活力。

该数据集为研究星形胶质细胞对散发性阿尔茨海默病病理生理学的特异性贡献提供了宝贵资源，并为了解患者来源的星形胶质细胞如何响应关键神经退行性触发因素提供了见解。所有数据、方案和元数据均公开可用，以支持神经科学和干细胞研究界的可重复性和进一步探索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。