tau蛋白病人尸检脑组织质谱蛋白质组学数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317746

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：以MAPT编码的异常tau在细胞内蓄积为特征的tau蛋白病的分子机制仍知之甚少。目的：采用质谱法鉴定与原发性tau蛋白病——皮质基底节变性（CBD）和进行性核上性麻痹（PSP）——以及继发性tau蛋白病阿尔茨海默病（AD）相关的蛋白质。方法：从AD（n = 4）、CBD（n = 4）、PSP（n = 4）患者及其各自对照（n = 4）的死后人脑组织中制备总匀浆，并进行质谱分析。比较四组间的蛋白质水平，随后对显示统计学显著差异的蛋白质进行功能富集和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析。对于显示显著差异的一部分蛋白质，进行免疫组织化学以确定其在脑内的分布。此外，分析单核RNA测序数据，以在RNA水平上以细胞类型特异性方式评估四组中相应基因的表达。

结果：在四组比较中，分别有859、114、6和1个蛋白质的P值<0.05、<0.01、<0.005和<0.001。我们随后重点关注P值<0.005的6个蛋白质（AK3、ATP5PD、COX7C、PPA1、PREP和UQCRC1），并进行了功能富集和PPI分析。这些分析显示，所鉴定的tau蛋白病相关蛋白质主要参与线粒体功能。讨论：年龄相关的线粒体功能障碍可能影响tau蛋白病的发病和进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。