区室特异性线粒体未折叠蛋白反应数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE315336),聚焦阿尔茨海默病中微胶质细胞区室特异性线粒体应激反应。数据通过高通量测序表达谱分析,比较 APP 表达与 UPRmt-MM、UPRmt-IMS 靶向激活产生的转录特征,涵盖免疫激活、氧化磷酸化受损及线粒体核糖体完整性破坏等方向

geo
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基因组分类GPL111549606
GSE315336: Compartment specific mitochondrial unfolded protein response

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

区室特异性线粒体未折叠蛋白反应数据集

Compartment specific mitochondrial unfolded protein response

该数据集来自 NCBI GEO(GSE315336),聚焦阿尔茨海默病中微胶质细胞区室特异性线粒体应激反应。数据通过高通量测序表达谱分析,比较 APP 表达与 UPRmt-MM、UPRmt-IMS 靶向激活产生的转录特征,涵盖免疫激活、氧化磷酸化受损及线粒体核糖体完整性破坏等方向。可用于研究线粒体区室化在 AD 发病机制中的作用,并探索潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病缺乏有效的疾病修饰治疗,部分原因是微胶质细胞中早期、区室特异性的线粒体应激反应仍定义不清。我们的研究结果表明,APP 表达以及 UPRmt-MM 或 UPRmt-IMS 的靶向激活产生不同的转录特征——从免疫激活和氧化磷酸化受损到线粒体核糖体完整性破坏——突显线粒体区室化是 AD 发病机制的关键驱动因素和潜在治疗靶点。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315336

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 09 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病缺乏有效的疾病修饰治疗,部分原因在于小胶质细胞中早期、区室特异性的线粒体应激反应仍未被充分界定。我们的研究结果表明,APP表达以及UPRmt-MM或UPRmt-IMS的靶向激活会产生不同的转录特征——从免疫激活和氧化磷酸化受损到线粒体核糖体完整性破坏——突显线粒体区室化是AD发病机制的关键驱动因素及潜在治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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