BPAN患者iPSC衍生小胶质细胞的异常免疫调节特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313884

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数据说明

采用NanoString nCounter人类神经炎症检测面板，对源自BPAN患者和健康对照的iPSC衍生小胶质细胞进行了靶向基因表达谱分析。本研究旨在识别与BPAN发病机制相关的疾病相关免疫和炎症转录特征。小胶质细胞是大脑的常驻免疫细胞，对维持稳态至关重要，并参与阿尔茨海默病和帕金森病(PD)等常见神经退行性疾病，在这些疾病中，小胶质细胞的早期激活和持续的炎症介质释放先于神经元丢失。相比之下，它们在罕见疾病中的作用尚不清楚。β-螺旋蛋白相关性神经退行性疾病(BPAN)由WDR45突变引起，与PD具有关键共同特征，包括铁积累和多巴胺能神经元丢失，但小胶质细胞和突变WDR45在BPAN中的影响仍未被探索。为解决这一问题，我们建立了首个来自BPAN患者的iPSC衍生小胶质细胞模型。整合转录组学和蛋白质组学分析揭示了从稳态向反应性、促炎状态的转变，伴随自噬失调、应激反应和慢性免疫激活。

补充性分泌组分析发现溶酶体功能受损和抗原呈递增加，支持小胶质细胞持续激活。这些发现表明功能失调的小胶质细胞参与BPAN的发病机制，并为免疫调节治疗提供了新方向。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。