STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理 [RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理的RNA-seq数据,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类
![GSE313022: STING–IFN–CH25H lipid axis links innate immune activation to tau pathology [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/146609.jpg)
基本信息
资源简介
STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理 [RNA-seq]
STING–IFN–CH25H lipid axis links innate immune activation to tau pathology [RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理的RNA-seq数据,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类。数据包含1个文件(GSE313022_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序的表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。数据可用于研究cGAS-STING–IFN通路下游25-羟基胆固醇在tau病理模型中对小胶质细胞炎症、tau聚集及神经元功能的影响(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病的遗传风险强烈富集于调控小胶质细胞激活和胆固醇代谢的通路,然而这些过程如何汇聚驱动神经退行性变仍不清楚。在此,我们将氧固醇25-羟基胆固醇(25-HC)鉴定为cGAS-STING–IFN通路下游的致病性脂质。在tau病理模型中,干扰素信号诱导小胶质细胞中胆固醇25-羟化酶(CH25H)的表达。在雌性P301S小鼠中敲除Ch25h可抑制tau聚集、保护突触、防止脑萎缩并挽救记忆。机制上,CH25H缺失破坏了STING转运,减弱了IFN激活,抑制了自我维持的小胶质细胞炎症。引人注目的是,25HC直接加速了人iPSC来源神经元中的tau传播。它还破坏了溶酶体和线粒体脂质组成,驱动胆固醇酯积累
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313022
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
阿尔茨海默病的遗传风险强烈富集于调控小胶质细胞活化和胆固醇代谢的通路,然而这些过程如何汇聚驱动神经退行性变仍不清楚。在此,我们鉴定出氧固醇25-羟基胆固醇(25-HC)是cGAS-STING–IFN通路下游的致病性脂质。在tau病理模型中,干扰素信号诱导小胶质细胞中胆固醇25-羟化酶(CH25H)的表达。在雌性P301S小鼠中敲除Ch25h可抑制tau聚集、保护突触、防止脑萎缩并挽救记忆。机制上,CH25H缺失破坏了STING转运,减弱了IFN活化,抑制了自我延续的小胶质细胞炎症。引人注目的是,25HC直接加速了人iPSC来源神经元中的tau传播。它还破坏了溶酶体和线粒体的脂质组成,驱动胆固醇酯积累,并在tau诱导的应激下促进细胞凋亡。这些发现定义了一个STING–IFN–CH25H脂质轴,将先天免疫活化与tau病理和毒性联系起来,为炎症驱动的神经退行性疾病提供了一个可行的治疗途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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