STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理[scRNA-seq]

该数据集来自NCBI GEO,标题为STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理的单细胞RNA测序数据,归入神经系统疾病/阿尔茨海默病分类

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时间序列预测GPL2424710090
GSE313021: STING–IFN–CH25H lipid axis links innate immune activation to tau pathology [scRNA-seq]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理[scRNA-seq]

STING–IFN–CH25H lipid axis links innate immune activation to tau pathology [scRNA-seq]

该数据集来自NCBI GEO,标题为STING–IFN–CH25H脂质轴连接先天免疫激活与tau病理的单细胞RNA测序数据,归入神经系统疾病/阿尔茨海默病分类。源站描述聚焦cGAS-STING–IFN通路下游的25-羟基胆固醇在tau病理模型中的作用,涉及小胶质细胞CH25H表达、tau聚集、突触保留、脑萎缩与记忆等表型。数据含1个文件(GSE313021_series_matrix.txt.gz),可用于研究阿尔茨海默病中先天免疫与胆固醇代谢交汇的转录组特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病的遗传风险强烈富集于调控小胶质细胞激活和胆固醇代谢的通路,然而这些过程如何汇聚驱动神经退行性变仍不清楚。在这里,我们将氧固醇25-羟基胆固醇(25-HC)鉴定为cGAS-STING–IFN通路下游的致病性脂质。在tau病理模型中,干扰素信号诱导小胶质细胞中胆固醇25-羟化酶(CH25H)的表达。在雌性P301S小鼠中敲除Ch25h可抑制tau聚集、保留突触、防止脑萎缩并挽救记忆。机制上,CH25H缺失破坏了STING运输,减弱了IFN激活,抑制了自我延续的小胶质细胞炎症。引人注目的是,25HC直接加速了人iPSC衍生神经元中的tau传播。它还破坏了溶酶体和线粒体脂质组成,驱动胆固醇酯积累

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313021

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病的遗传风险强烈富集于调控小胶质细胞活化和胆固醇代谢的通路,然而这些过程如何汇聚驱动神经退行性变仍不清楚。在此,我们鉴定出氧固醇25-羟基胆固醇(25-HC)是cGAS-STING–IFN通路下游的致病性脂质。在tau病理模型中,干扰素信号诱导小胶质细胞中胆固醇25-羟化酶(CH25H)的表达。在雌性P301S小鼠中敲除Ch25h可抑制tau聚集、保护突触、防止脑萎缩并挽救记忆。机制上,CH25H缺失破坏了STING转运,减弱了IFN活化,抑制了自我延续的小胶质细胞炎症。引人注目的是,25HC直接加速了人iPSC来源神经元中的tau传播。它还破坏了溶酶体和线粒体的脂质组成,驱动胆固醇酯积累,并在tau诱导的应激下促进细胞凋亡。这些发现定义了一个STING–IFN–CH25H脂质轴,将先天免疫活化与tau病理和毒性联系起来,为炎症驱动的神经退行性疾病提供了一个可行的治疗途径。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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