配对血管-实质单核测序揭示阿尔茨海默病内皮-间质转化扰动

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310554

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

神经血管单元（NVU）通过整合血管细胞、神经元和胶质细胞，确保代谢支持和血脑屏障完整性，在维持脑功能中发挥关键作用。尽管血管功能障碍已被认为与阿尔茨海默病（AD）相关，但各类血管细胞的具体贡献仍研究不足，部分原因在于从死后组织中分离这些细胞存在困难。在本研究中，我们利用单核RNA测序分析了AD患者和对照受试者的前额叶皮层组织，构建了涵盖主要血管细胞和实质细胞类型的高分辨率图谱。我们的研究结果揭示了AD风险与周细胞、血管周围成纤维细胞和活化小胶质细胞特异性基因表达谱之间的明显关联。功能分析表明，这些基因汇聚于淀粉样蛋白相关通路，提示血管周围腔室和免疫调节因子在AD病理生物学的早期阶段发挥重要作用。

此外，我们发现了一个新的内皮-间质转化细胞群体，该群体在AD中减少，提示内皮可塑性可能受损，进而可能导致血管功能障碍。血管与实质细胞类型之间的关键配体-受体相互作用（如ANGPT2）被发现显著失调，凸显了可能驱动AD中NVU破坏的潜在靶点。这些发现为评估人类疾病中的NVU细胞提供了全面框架，并强调了血管动态与AD发病机制之间的新联系。该研究为疾病机制提供了宝贵见解，并提出了旨在保护和恢复大脑神经血管界面的新治疗途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。