阿尔茨海默病患者颞叶皮层差异表达miRNA及其与tau病理关联数据集

该数据集来自NCBI GEO(GSE309036),聚焦阿尔茨海默病(AD)患者颞上T1等皮层中差异表达的microRNA(miRNA)

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基因组分类GPL185739606
GSE309036: Differentially expressed miRNAs in the temporal cortex of Alzheimer’s disease patients and their association to tau pathology.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

阿尔茨海默病患者颞叶皮层差异表达miRNA及其与tau病理关联数据集

Differentially expressed miRNAs in the temporal cortex of Alzheimer’s disease patients and their association to tau pathology.

该数据集来自NCBI GEO(GSE309036),聚焦阿尔茨海默病(AD)患者颞上T1等皮层中差异表达的microRNA(miRNA)。研究采用下一代测序(NGS)鉴定差异表达miRNA,并用RT-qPCR进行验证,同时探讨这些miRNA与tau病理的关联。数据包含1个系列矩阵文件,可用于AD相关miRNA表达谱分析、生物标志物筛选及非编码RNA调控机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 24 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病(AD)是老年人痴呆的主要病因,以记忆和行为进行性损害为特征。AD具有病理标志:淀粉样斑块和神经原纤维缠结(NFTs)。尽管为理解这些标志物付出了大量努力,但由于对该疾病基本细胞机制了解有限,仍缺乏有效的治疗方法。一个潜在的研究途径是研究非编码RNA的作用,特别是微小RNA(miRNA),它们与靶mRNA的3' UTR结合以抑制表达。在我们的研究中,我们分析了对照和AD患者的颞上T1等皮层,使用下一代测序(NGS)鉴定差异表达的miRNA。为了验证这些发现,我们使用了另一种技术RT-qPCR。总体而言,我们的研究conf

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309036

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 09 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309036

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病(AD)是老年人痴呆的主要致病因素,其特征为记忆和行为能力的进行性损害。AD具有典型的病理标志:淀粉样斑块和神经原纤维缠结(NFTs)。尽管为理解这些病理标志付出了大量努力,但由于对该疾病潜在基本细胞机制的认识有限,目前仍缺乏有效的治疗手段。一个潜在的研究方向涉及非编码RNA的作用,尤其是微小RNA(miRNAs),它们与靶mRNA的3’ UTR结合以抑制表达。在本研究中,我们分析了对照组和AD患者颞上T1等皮质,利用下一代测序(NGS)鉴定差异表达的miRNAs。为验证这些发现,我们采用了另一种技术——RT-qPCR。总体而言,我们的研究证实了先前关于miR-129-5p、miR-132-3p和miR-146b-5p失调的发现,同时也为miR-151a-5p和miR-1-3p的失调提供了新的见解。

重要的是,miR-129-5p、miR-146b-5p、miR-132-3p和miR-151a-5p的表达水平与神经病理学Braak分期以及脑匀浆中生化定量的tau磷酸化水平显著相关。此外,我们发现miR-146b-5p和miR-151a-5p在tau生物传感器细胞模型中显著调节tau种子活性,突显了它们在tau病理中的潜在作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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