阿尔茨海默病相关PLCG2变异对人iPSC来源小胶质样细胞状态与功能的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308813

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：PLCG2是一种关键的小胶质细胞免疫信号蛋白，其变异与阿尔茨海默病（AD）风险存在遗传关联。了解PLCG2变异如何改变小胶质细胞功能，对于识别驱动AD神经退行性变或韧性的机制至关重要。方法：为确定对小鼠小胶质细胞转录组和功能的影响，研究构建了携带保护性PLCG2P522R或风险相关PLCG2M28L变异，或PLCG2缺失的iPSC来源小胶质细胞。结果：保护性PLCG2P522R小胶质细胞在转录组上与同基因对照显示出显著相似性。相反，风险相关PLCG2M28L小胶质细胞与PLCG2KO小胶质细胞具有相似性，表现为TREM2表达功能性降低、炎症反应减弱以及增殖和细胞死亡增加。独特的是，PLCG2P522R小胶质细胞在LPS刺激后显示出细胞因子分泌升高，并受到保护免于凋亡。讨论：这些发现表明，PLCG2变异驱动不同的小胶质细胞转录组，从而影响小胶质细胞功能反应，这可能促进AD风险和保护。

靶向PLCG2介导的信号传导可能是一种调节神经炎症的有效治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。