TREM2-T96K功能获得性突变通过损害小胶质细胞功能增加阿尔茨海默病风险

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307564

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是通过将组成型Trem2T96K敲入小鼠与阿尔茨海默病(AD)的5xFAD小鼠模型杂交，表征Trem2T96K功能获得性突变在AD发病机制中的潜在分子机制。我们对8月龄的雄性及雌性Trem2+/+ (WT)、5xFAD;Trem2+/+、5xFAD;Trem2T96K/+和5xFAD;Trem2T96K/T96K小鼠分离的小胶质细胞进行了基因表达分析，以分析Trem2T96K突变在神经炎症环境（即5xFAD脑内）中对小胶质细胞转录组的影响。结果显示，Trem2T96K重编程了小胶质细胞的基因表达，并下调了与小胶质细胞功能相关的信号通路，尤其是在雌性5xFAD小鼠中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。