HDL模拟肽治疗逆转人源化APOE小鼠脑内APOE4诱导的转录组与脂质组改变

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307255

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数据说明

引言：载脂蛋白E4（APOE4）等位基因是晚发性阿尔茨海默病（AD）最强的遗传风险因素。APOE4的脂化能力降低、脂质转运受损，从而破坏神经元的维持。高密度脂蛋白（HDL）模拟肽4F提供了一种潜在的治疗策略。方法：为探究APOE4如何改变脑基因表达和脂质代谢，并评估4F的治疗潜力，我们对APOE4/4（E4/4）和APOE3/3（E3/3）小鼠进行了双组学分析，这些小鼠从12周龄至13月龄经腹腔注射4F的D型对映体（D4F）或赋形剂。结果：APOE4/4小鼠表现出广泛的转录组和脂质组改变，包括脂质代谢和突触通路下调，神经酰胺、鞘磷脂和胆固醇酯增加，以及甘油三酯和甘油二酯减少。D4F治疗使基因表达和脂质谱恢复至接近APOE3/3水平。讨论：这些发现揭示了APOE4驱动失调的分子机制，并支持HDL模拟肽在减轻AD中APOE4相关改变方面的治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。