雌性5xFAD阿尔茨海默病小鼠小胶质细胞干扰素信号与Aβ斑块病理增强且不依赖动情周期阶段

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306854

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病（AD）呈现出性别偏倚，女性患病风险更高，且与男性相比表现出更严重的认知衰退和脑萎缩。小胶质细胞在AD的发病机制和进展中发挥重要作用，并已被证明在健康和疾病状态下存在性别分化。小胶质细胞是否以及如何参与AD中的性别差异仍有待阐明。在此，我们表征了雌性和雄性在响应淀粉样蛋白-β（Aβ）时小胶质细胞转录组变化中的性别差异。在雌性中，我们聚焦于啮齿动物动情周期的两个激素水平不同的阶段：动情前期和动情间期。我们的转录组数据显示，雌性小胶质细胞在动情前期或动情间期阶段并无明显差异。然而，我们发现在5xFAD大脑中，雌性和雄性小胶质细胞转录组之间存在显著的性别差异，其中与雄性5xFAD小胶质细胞相比，雌性5xFAD小胶质细胞上调了参与糖酵解代谢、抗原呈递、疾病相关小胶质细胞以及小胶质细胞神经退行性表型（DAM/MGnD）的基因。

有趣的是，雌性和雄性5xFAD小胶质细胞之间差异表达基因（DEGs）中有相当一部分是干扰素刺激基因（ISGs），而这些基因在雌性中均上调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。