p16INK4a转录停滞损害阿尔茨海默病线粒体生物能量与认知功能 [ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305455

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CDKN2A/p16INK4a是细胞衰老的经典标志物，并与衰老相关神经退行性疾病有关，包括阿尔茨海默病（AD）。然而，神经元p16INK4a如何促进神经退行性变仍不清楚，因为既往研究主要集中于胶质细胞中的作用。在此，我们发现p16INK4a在AD患者脑及小鼠模型的海马颗粒神经元中选择性上调。机制上，p16INK4a直接结合GTF2H1——转录因子IIH（TFIIH）复合物的核心亚基，空间位阻阻碍GTF2H1与RNA聚合酶II的组装。这种破坏导致全基因组转录停滞，并优先下调线粒体电子传递链基因。值得注意的是，p16INK4a过表达使线粒体呼吸复合物I亚基NDUFB9的转录停滞，诱导线粒体功能障碍和神经元能量缺陷。海马p16Ink4a过表达损害野生型小鼠的突触可塑性和记忆，并加剧AD小鼠的认知衰退，而其敲低则恢复转录活性、突触功能和记忆表现。

这些发现揭示了一条此前未被识别的p16INK4a介导的级联通路，将神经元衰老与神经退行性变联系起来，并确立p16INK4a通过直接抑制核心转录机器而成为突触功能障碍的主动驱动因素。因此，靶向p16INK4a–GTF2H1相互作用或可为AD提供一种治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。