PHGDH的RNA结合活性驱动散发性阿尔茨海默病人脑类器官模型中的淀粉样蛋白β生成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302314

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数据说明

散发性阿尔茨海默病（sAD）的病理进展始于可溶性淀粉样蛋白-β（Aβ）的早期升高，这一变化先于斑块形成和神经退行性变。然而，触发这一初始积累的分子事件尚不清楚。我们发现，磷酸甘油酸脱氢酶（PHGDH）——一种前驱期sAD的稳定生物标志物——通过一种此前未被认识的RNA结合功能驱动Aβ的产生。具体而言，PHGDH结合EIF2AK1 mRNA的3′UTR，从而使PHGDH与EIF2AK1蛋白之间发生物理相互作用。通过促进EIF2AK1被招募至其底物EIF2α，该复合物驱动EIF2α磷酸化，从而选择性促进BACE1的翻译，而BACE1是Aβ生成的关键限速酶。我们证明，在小鼠模型和人脑类器官中，PHGDH过表达可升高神经元和星形胶质细胞中的BACE1蛋白及细胞内Aβ（iAβ），且不依赖其经典酶学功能或转录功能。在机制上，该过程需要PHGDH内部一个特定的RNA结合表面以及EIF2AK1 3′UTR。

这些发现确立了PHGDH-EIF2AK1-EIF2α-BACE1轴作为散发性阿尔茨海默病（sAD）最早淀粉样蛋白病理的关键驱动因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。