GSE301217：生活方式塑造阿尔茨海默病小鼠模型病前社交与小胶质细胞缺陷

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301217

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数据说明

在本研究中，我们使用了阿尔茨海默病敲入小鼠模型App-NL-G-F小鼠。作为生活方式因素的简化模型，我们采用了一种新颖的环境丰富化（ENR）范式，对App-NL-G-F小鼠和对照组（App-NL）小鼠持续追踪至7月龄。作为比较，两种基因型的小鼠均饲养于标准（STD）笼具中，以识别群居饲养和探索活动的影响。尽管斑块负荷极小且无记忆损害，这些小鼠在社会行为参数方面表现出进行性缺陷——如跟随行为、社会互动和探索——提示早期行为脆弱性。至7月龄时，成年神经发生与社会行为参数之间的相关性发生改变，将神经可塑性与病前行为联系起来。小胶质细胞的形态学分析表明，社会活动较多的动物中小胶质细胞覆盖面积增加。探索活跃的对照组小鼠（而非App-NL-G-F小鼠）表现出更多分支状、更少阿米巴样的小胶质细胞，提示这种关系被病理所扰乱。实验结束时，随机选取的动物被处理用于海马小胶质细胞的单细胞RNA测序。

在App-NL-G-F小鼠中，环境丰富化抑制了干扰素反应性小胶质细胞，而这类细胞通常随淀粉样变性进展而增多。免疫反应的转变表现为抗原加工与呈递相关基因转录减少以及趋化因子信号增强。我们的研究表明，在阿尔茨海默病小鼠模型中，临床前期的改变涉及多个领域，包括大脑、行为和免疫系统，彼此交织；因此，这为研究病理与行为之间复杂的相互作用（在阿尔茨海默病发病前阶段）提供了实验途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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