阿尔茨海默病、CADASIL与创伤性脑损伤小鼠模型中异质性微胶质反应与稳定血管转录程序对比(主数据集)
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含阿尔茨海默病、CADASIL 和创伤性脑损伤三种小鼠模型的单细胞转录组数据,覆盖主要血管细胞类型与微胶质细胞,涉及超过 250,000 个细胞及不同疾病阶段

基本信息
资源简介
阿尔茨海默病、CADASIL与创伤性脑损伤小鼠模型中异质性微胶质反应与稳定血管转录程序对比(主数据集)
Heterogenous microglial reactivity contrasts with stable vascular transcriptional programs in mouse models of Alzheimer’s, CADASIL, and Traumatic Brain Injury (Main dataset)
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含阿尔茨海默病、CADASIL 和创伤性脑损伤三种小鼠模型的单细胞转录组数据,覆盖主要血管细胞类型与微胶质细胞,涉及超过 250,000 个细胞及不同疾病阶段。数据可用于比较三种脑疾病中血管细胞与微胶质细胞的转录组反应,识别血管细胞亚型、拓展内皮分区谱,并分析神经炎症相关血管反应性的分子变化。文件数量为 1,样例文件为 GSE300113_series_matrix.txt.gz(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):脑血管系统在各种脑部疾病中受影响的程度仍未被充分了解。为解决这一问题,我们建立了一个包含主要血管细胞类型和微胶质细胞的转录组库,以比较三种与神经炎症及相关血管反应性有关的人类脑部疾病小鼠模型的转录组反应:阿尔茨海默病(AD)、创伤性脑损伤(TBI)和伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(CADASIL)。对不同疾病阶段的超过250,000个细胞进行单细胞分析,鉴定出两种此前未知的血管细胞亚型,扩展了内皮分区谱,并允许对血管细胞和微胶质细胞中的分子反应进行详细分析。令人惊讶的是,在所有三种c
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL30172、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300113
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 24 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
脑血管在各种脑部疾病中受影响的程度仍未被充分了解。为解决这一问题,我们建立了一个包含主要血管细胞类型和小胶质细胞的转录组库,以比较三种与神经炎症及相关血管反应性有关的人类脑部疾病小鼠模型中的转录组反应:阿尔茨海默病(AD)、创伤性脑损伤(TBI)以及伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(CADASIL)。对不同疾病阶段的超过250,000个细胞进行单细胞分析,鉴定出两种此前未知的血管细胞亚型,扩展了内皮分区谱,并使得对血管细胞和小胶质细胞中分子反应的详细分析成为可能。出乎意料的是,在三种条件下,所有血管细胞类型在转录组上均保持正常,而小胶质细胞则表现出显著的、疾病特异性的转录变化。值得注意的是,小胶质细胞的反应在晚期TBI和AD之间趋同,为TBI后神经退行性变的易感性提供了新的见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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