GSE300079：小鼠APOE4向APOE2等位基因切换改善阿尔茨海默病相关代谢特征、神经病理与认知

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300079

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

与携带载脂蛋白E（APOE）ε4等位基因两个拷贝的个体相比，ε2纯合子罹患晚发性阿尔茨海默病（AD）的风险降低约99%。在此，我们构建了一种转基因小鼠模型，该模型可实现风险等位基因与保护等位基因之间的诱导性“切换”（APOE4s2）。基因表达与蛋白质组学分析证实，APOE4s2小鼠在基线状态下合成E4，在给予他莫昔芬后合成E2。全身性等位基因切换可产生类似于E2/E2人类的代谢谱，并驱动脂质组和单细胞转录组中与AD相关的改变，尤其是在星形胶质细胞中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。