人海马阿尔茨海默病组织中与微管相关蛋白tau相互作用的mRNA的m6A甲基化分析与统计

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299570

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

微管相关蛋白tau（MAPT，tau）是包括阿尔茨海默病在内的多种神经退行性疾病的主要病理因素。Tau可与RNA相互作用。这些相互作用被认为是疾病中观察到的病理性tau形式形成的启动因素。此外，有研究提出RNA的m6A甲基化状态是RNA与tau结合的一个影响因素。本研究采用增强型交联免疫沉淀（eCLIP）技术，以：1）鉴定、定量并测序从阿尔茨海默病人脑海马组织中分离的tau蛋白所相互作用的RNA种类；2）鉴定、定量并测序阿尔茨海默病人脑海马组织中的甲基化RNA；3）探寻与tau相互作用的RNA和RNA甲基化状态之间的关联。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。