GSE299277：ABCA7变异影响神经元磷脂酰胆碱与线粒体

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299277

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数据说明

脂质转运蛋白ABCA7的功能缺失（LoF）变异会显著增加阿尔茨海默病风险（比值比约为2），但其潜在的致病机制及受影响的具体神经细胞类型仍不清楚。为探究这一问题，我们构建了包含36份人类死后前额叶皮层样本的单核RNA测序图谱，其中包括12名ABCA7 LoF变异携带者和24名匹配的非携带者。ABCA7 LoF变异与所有主要神经细胞类型的转录变化相关。表达ABCA7水平最高的兴奋性神经元在氧化磷酸化、脂质代谢、DNA损伤反应和突触信号通路方面表现出显著改变。神经元中与ABCA7 LoF相关的转录变化在常见AD错义变异ABCA7 p.Ala1527Gly的携带者（n = 240名对照，135名携带者）中同样受到扰动——分子动力学模拟预测该变异会破坏ABCA7结构——这表明本研究的结果可能适用于很大一部分高风险人群。

携带ABCA7功能缺失（LoF）变体的人诱导多能干细胞（iPSC）来源神经元，高度重现了在人类死后神经元中观察到的转录变化。生化实验进一步表明，ABCA7 LoF通过受调控的解偶联破坏线粒体膜电位，增加氧化应激，并改变神经元中的磷脂稳态，尤其是升高饱和磷脂酰胆碱水平。补充CDP-胆碱以增强磷脂酰胆碱的从头合成，可有效逆转这些转录变化，恢复线粒体解偶联，并降低氧化应激。此外，CDP-胆碱使ABCA7 LoF神经元的淀粉样蛋白-β分泌正常化，并减轻神经元过度兴奋。本研究提供了ABCA7 LoF诱导变化的详细转录组图谱，并强调磷脂酰胆碱代谢是ABCA7所致风险的关键驱动因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。