斑块诱导小胶质细胞向淋巴样受体表达的转录重编程保护抵抗阿尔茨海默病

该数据集来自 NCBI GEO(GSE296523),采用 10x Genomics snRNA-seq 单核测序方法,研究 PU.1 表达水平如何决定与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞激活状态

geo
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基因组分类GPL1702110090
GSE296523: Plaque-induced transcriptional reprogramming of microglia towards lymphoid receptor expression protects against Alzheimer's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

斑块诱导小胶质细胞向淋巴样受体表达的转录重编程保护抵抗阿尔茨海默病

Plaque-induced transcriptional reprogramming of microglia towards lymphoid receptor expression protects against Alzheimer's disease

该数据集来自 NCBI GEO(GSE296523),采用 10x Genomics snRNA-seq 单核测序方法,研究 PU.1 表达水平如何决定与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞激活状态。数据覆盖小胶质细胞在疾病中的神经保护与神经毒性功能及其调控机制,包含 1 个文件(GSE296523_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090)。可用于探索小胶质细胞向淋巴样基因表达转变所介导的保护功能及相关细胞状态分类研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 07 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们利用 10x Genomics snRNA-seq 的单核测序方法,以理解 PU.1 表达水平在决定与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞激活状态中的作用。小胶质细胞已被证明在疾病过程中兼具神经保护和神经毒性功能,然而这些状态如何被调控仍待阐明。本研究为小胶质细胞通过向淋巴样基因表达的转录转变所介导的保护功能提供了新见解。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296523

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 06 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们采用10x Genomics单核RNA测序(snRNA-seq)的单核测序方法,探究PU.1表达水平在决定与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞激活状态中的作用。研究表明,小胶质细胞在疾病过程中兼具神经保护和神经毒性功能,然而这些状态如何受到调控仍不清楚。本研究为小胶质细胞通过向淋巴样基因表达转变所介导的保护功能提供了新的见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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