TREM2表达水平对小胶质细胞状态、代谢能力及TREM2激动剂疗效的关键作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295016

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓系细胞触发受体2（TREM2）是小胶质细胞活性的核心调节因子，其序列变异是迟发性阿尔茨海默病（LOAD）的主要风险因素。为更好地理解与TREM2信号相关的分子和功能变化，我们构建了TREM2报告小鼠模型，并观察到报告基因表达随斑块邻近程度增加而逐渐上调。我们根据报告基因表达对分离的小胶质细胞进行分选，并在野生型和APP转基因动物中获取其转录组图谱，从而得以区分TREM2特异性效应与病理特异性效应。批量RNA测序突显了主要免疫代谢通路中TREM2水平依赖性变化，其中TREM2表达增加的小胶质细胞中氧化磷酸化和胆固醇代谢相关基因富集。为证实这些发现，我们接下来分析了氟脱氧葡萄糖（FDG）的摄取，并检测了代谢组学和脂质组学图谱。同样，独立于Aβ病理，TREM2表达与FDG摄取以及细胞氧化还原、能量代谢和胆固醇稳态的增加相关。

最后，我们使用一种可穿透血脑屏障的TREM2激动剂进行了长期治疗，并确定了TREM2表达的一个窗口期，在此期间小胶质细胞的反应最为敏感。因此，我们的数据为TREM2介导的小胶质细胞代谢功能调控提供了新的见解，并为当前将TREM2激动剂推向临床应用的尝试提供了信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。