GSE294848:翻译保留内含子11序列赋予阿尔茨海默病Tau病理特性
该数据集来自NCBI GEO,聚焦阿尔茨海默病中Tau蛋白的病理机制,研究Tau11i异构体特有的19氨基酸内含子肽如何介导高分子量寡聚体形成、与Tau441形成稳定异二聚体、增强液-液相分离,并在体外更高效地聚集为富含β折叠的纤维

基本信息
资源简介
GSE294848:翻译保留内含子11序列赋予阿尔茨海默病Tau病理特性
Translated retained intron 11 sequence confers pathological properties to Tau in Alzheimer’s disease
该数据集来自NCBI GEO,聚焦阿尔茨海默病中Tau蛋白的病理机制,研究Tau11i异构体特有的19氨基酸内含子肽如何介导高分子量寡聚体形成、与Tau441形成稳定异二聚体、增强液-液相分离,并在体外更高效地聚集为富含β折叠的纤维。数据包含1个文件,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台为GPL24676。可用于探索Tau11i在Tau病理传播中的角色及相关分子机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 16 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Tau蛋白病理性聚集为寡聚体和纤维在阿尔茨海默病(AD)中起核心作用。在此,我们探索了仅在Tau11i异构体中发现的独特19氨基酸内含子肽所赋予的生化和细胞特性。我们证明该内含子肽介导高分子量(HMW)寡聚体的稳健形成,这些寡聚体抵抗变性和还原条件,从而将Tau11i与缺乏该序列的其他Tau异构体区分开来。Tau11i还独特地与Tau441形成稳定异二聚体,提示其在Tau病理传播中的作用。此外,该内含子肽增强Tau11i的液-液相分离(LLPS),这是与病理性聚集相关的关键早期事件。体外实验表明,Tau11i比其他Tau异构体更高效地聚集为富含β折叠的纤维,显著fa
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294848
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 26 202,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
Tau蛋白病理性聚集成寡聚体和纤维在阿尔茨海默病(AD)中起核心作用。在此,我们探讨了仅存在于Tau11i亚型中的一段独特19氨基酸内含子肽所赋予的生化与细胞特性。我们证明,该内含子肽介导了高分子量(HMW)寡聚体的稳健形成,这些寡聚体能够抵抗变性和还原条件,从而将Tau11i与缺乏该序列的其他Tau亚型区分开来。Tau11i还独特地与Tau441形成稳定的异二聚体,提示其在Tau病理传播中的作用。此外,该内含子肽增强了Tau11i的液-液相分离(LLPS),这是与病理性聚集相关的关键早期事件。体外实验表明,Tau11i比其他Tau亚型更高效地聚集为富含β-折叠的纤维,显著促进Tau生物传感器细胞中的纤维形成和细胞播种。
转录组分析表明,涉及免疫应答、突触功能和代谢的神经元通路存在显著失调,表达Tau11i的神经元与AD神经元的基因表达模式高度相似,尤其是AT8阴性亚型。此外,Tau11i特异性与应激颗粒相关RNA结合蛋白相互作用,尤其是PABPC1,提示其参与应激颗粒动态和RNA稳态。总体而言,这些发现表明该内含子肽是驱动Tau11i特异性寡聚化及阿尔茨海默病相关早期分子改变的关键因素,凸显其作为独立于经典Tau病理的新型治疗靶点的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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