GSE293791：具有播种能力的早期tau多聚体与细胞类型特异性转录特征相关

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293791

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数据说明

阿尔茨海默病(AD)最初的分子改变尚不清楚。确诊的AD以人脑显著的结构和转录改变为特征，其标志性神经病理特征为老年斑中β-淀粉样蛋白(Aβ)的积聚以及神经原纤维缠结(NFTs)中过度磷酸化的纤维状tau。既往证据表明，tau多聚化成小聚集体是最早的分子改变之一，先于过度磷酸化tau在NFTs中的积聚。在本研究中，我们探究了这些早期小tau多聚体的播种能力及与之相关的转录改变，旨在揭示AD型tau病理的早期致病过程。通过tau邻近连接 assay(tau-PLA)在死后颞叶皮层中可视化的早期tau多聚体，经实时震荡诱导转化(RT-QuIC)检测显示出高播种活性，并能在tau生物传感器细胞系中诱导聚集体形成。

利用单核转录组学技术，我们发现，与既缺乏多聚体又缺乏神经原纤维缠结（NFTs）的对照组织相比，含有具备播种能力的早期tau多聚体但无明显NFT病理的脑组织，在多种细胞类型中均伴有显著的基因表达改变。差异表达基因如APP、MAPT和PSEN1，在兴奋性神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞的上调基因中显示出AD遗传力的显著富集。伪时间分析揭示了tau病理进展与反应性星形胶质细胞标志基因表达之间的正相关。总之，我们的结果支持这一假说：具备播种能力的tau多聚化可能在tau在NFTs中积累之前即启动AD型tau病理级联反应。本研究为与AD相关的早期分子事件提供了宝贵见解，并对未来的诊断和治疗策略具有启示意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。