GSE290806：衰老过程中小脑微胶质细胞重组的空间与单细胞转录组

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290806

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数据说明

衰老会导致大脑各区域出现特异性的功能衰退。小脑对运动协调和认知功能至关重要，随着年龄增长会发生显著的结构和功能变化。驱动小脑衰老的分子机制——尤其是小脑胶质细胞（包括小胶质细胞）的作用——仍知之甚少。在本研究中，我们采用单核RNA测序（snRNA-seq）、小胶质细胞批量RNA测序以及多重误差稳健荧光原位杂交（MERFISH）技术，表征了小鼠小脑中与细胞衰老相关的转录变化。我们发现，在所有细胞类型中，小胶质细胞表现出最显著的年龄相关变化，且其转录特征表明，与海马小胶质细胞相比，其神经保护性免疫激活增强、脂滴积累减少。此外，与年轻小鼠相比，老年小鼠的小脑小胶质细胞被发现更靠近颗粒细胞。这种关系通过新定义的神经元相关小胶质细胞评分加以表征，该评分捕捉了邻近依赖性转录变化，并提示了一种新型的小胶质细胞响应性。

这些发现强调了小脑在衰老过程中的独特适应性及其对阿尔茨海默病（AD）相关病理的潜在抵抗力，为可能影响疾病易感性的区域特异性机制提供了关键见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。