雄性野生型小鼠与APP/PS1dE9阿尔茨海默病模型皮层星形胶质细胞功能亚群信号级联研究

该数据集来自NCBI GEO,包含雄性野生型小鼠与APP/PS1dE9阿尔茨海默病模型小鼠前额叶皮层星形胶质细胞的单细胞/细胞核表达谱数据

geo
浏览 12
时间序列分类GPL2424710090
GSE290101: Signaling cascades shape functional subpopulations of cortical astrocytes in male wild-type mice and APP/PS1dE9 Alzheimer’s disease model

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

雄性野生型小鼠与APP/PS1dE9阿尔茨海默病模型皮层星形胶质细胞功能亚群信号级联研究

Signaling cascades shape functional subpopulations of cortical astrocytes in male wild-type mice and APP/PS1dE9 Alzheimer’s disease model

该数据集来自NCBI GEO,包含雄性野生型小鼠与APP/PS1dE9阿尔茨海默病模型小鼠前额叶皮层星形胶质细胞的单细胞/细胞核表达谱数据。研究利用STAT3和NF-kB信号通路报告系统,识别出三种由信号活性定义的星形胶质细胞亚群,这些亚群并非由淀粉样蛋白沉积触发,在野生型小鼠中同样存在,并具有不同的形态、分子特征和功能谱。数据可用于探索星形胶质细胞亚群的分类标志、信号通路调控机制及其在阿尔茨海默病中的潜在作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):星形胶质细胞是神经元的关键伙伴,可影响阿尔茨海默病(AD)等疾病,因为它们表现出多种反应性变化。近期单细胞/细胞核基因组学分析证明,正常和AD大脑中并存星形胶质细胞亚群。然而,控制它们的信号级联、其功能特征及在AD中的作用仍不清楚。在此,借助针对STAT3和NF-kB信号通路(星形胶质细胞反应性的两个调节因子)的星形胶质细胞特异性报告系统,我们报告在雄性APP/PS1dE9小鼠前额叶皮层中存在三种由信号活性定义的星形胶质细胞亚群。这些亚群并非由淀粉样蛋白沉积触发,在野生型小鼠中也可观察到。它们显示出不同的形态、分子特征和功能谱。虽然NF-kB+星形胶质细胞具有更大的领地和更高的溶酶体活性

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290101

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 22 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290101

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

星形胶质细胞是神经元的关键伙伴,能够影响阿尔茨海默病(AD)等疾病,因为它们表现出多种反应性变化。近期单细胞/单核基因组学分析证实,正常脑和AD脑中存在共存的星形胶质细胞亚群。然而,控制这些亚群的信号级联、其功能特征及在AD中的作用仍不清楚。本研究借助针对STAT3和NF-kB信号通路(星形胶质细胞反应性的两个调控因子)的星形胶质细胞特异性报告系统,报道了雄性APP/PS1dE9小鼠前额叶皮层中存在三种由信号活性定义的星形胶质细胞亚群。这些亚群并非由淀粉样蛋白沉积触发,在野生型小鼠中亦可观察到。它们表现出不同的形态、分子特征和功能谱。NF-kB+星形胶质细胞具有更大的领域和更高的溶酶体活性,而STAT3+星形胶质细胞则表现出增强的缝隙连接半通道活性。特异性抑制这些亚群可减小淀粉样斑块大小,并影响AD小鼠(而非野生型小鼠)的焦虑、社交偏好和社交记忆。

我们的结果揭示了先天信号如何塑造小鼠大脑皮层中的星形胶质细胞亚群,这些亚群在健康和疾病状态下具有不同的功能。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案