阿尔法病毒感染后海马单细胞转录组变化与细胞重塑相关的慢性神经行为结局

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289596

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病毒感染，包括委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV），被比作帕金森病和阿尔茨海默病等神经系统疾病，但其机制仍不清楚。VEEV是一种嗜神经性甲病毒，可在人类中引起显著的神经功能缺损。对VEEV慢性影响的认识尚不充分，目前尚无抗病毒药物或神经保护治疗可用。本研究考察了经鼻感染VEEV TC-83的C57BL/6小鼠在纵向神经病理学、行为学及单细胞转录组学方面的变化。急性感染显著改变了炎症和先天免疫信号传导，并诱导星形胶质细胞和小胶质细胞活化以及海马神经元丢失。在感染后长达106天（DPI）观察到持续性运动功能障碍、记忆损害和焦虑样行为减少。这些变化与106 DPI时突触生成信号基因表达的改变、神经元丢失及持续性胶质细胞活化相关。总之，本研究表明，VEEV感染可诱导海马的慢性改变，这些改变可能与在人类患者中观察到的神经后遗症相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。