小鼠和人脑血管周围巨噬细胞cMAF依赖性转录程序调控内皮细胞功能[ChIP-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289366

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑周血管巨噬细胞维持着脑的生理功能，然而其转录调控因子以及在健康和疾病状态下的功能仍不清楚。我们运用单细胞多组学和功能实验，鉴定出cMAF是脑周血管巨噬细胞的关键转录因子。条件性敲除cMAF会破坏周血管巨噬细胞的表型，而不影响小胶质细胞。在功能上，cMAF驱动周血管巨噬细胞中IGF1的表达，使其能够与内皮细胞进行通讯。与此一致的是，在周血管巨噬细胞中敲除cMAF会引起脑动脉的转录改变，从而影响血管功能。值得注意的是，cMAF成为人类周血管巨噬细胞的主要转录因子，提示这一转录模块具有保守性。在阿尔茨海默病（AD）中，人类周血管巨噬细胞上调cMAF和IGF1以增强与血管细胞的通讯，而这一反应在APOE4携带者中被消除。最后，我们研究了一个尚未被表征的cMAF多态性，提供了cMAF程序对AD具有保护作用的证据。

靶向血管周围巨噬细胞中的cMAF可能为神经退行性疾病和脑血管疾病提供新的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。