额颞叶变性中hnRNP蛋白单细胞转录组水平与细胞定位改变

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288106

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

额颞叶痴呆（FTD）是一种具有强遗传成分的神经退行性疾病。额颞叶变性（FTLD）指FTD中所见的病理改变，其特征为额叶和颞叶萎缩以及异常蛋白包涵体的存在。在伴有过度磷酸化TDP-43阳性包涵体的FTLD（FTLD-TDP）中，根据脑内包涵体的类型和分布，可观察到五种病理亚型（A、B、C、D和E）。在所有亚型中，各病例之间所观察到的病理包涵体数量往往存在很大变异性，与临床表现的相关性有限。TDP-43是一种RNA结合蛋白，属于异质性核糖核蛋白（hnRNP）家族，与其他hnRNP共同调节RNA加工的多个方面。除TDP-43以外的hnRNP已涉及多种神经系统疾病，包括ALS、FTLD-TDP、FTLD-FUS和阿尔茨海默病。在FTLD-TDP的特定亚型中，已发现多种hnRNP存在于病理包涵体中，提示其可能在疾病过程中发挥作用。

hnRNP网络在FTLD疾病发病机制中的作用尚未被研究。本研究旨在通过免疫组织化学和单细胞RNA测序的基因表达分析，全面评估hnRNP蛋白在散发性FTLD-TDP两种病理亚型（A和C）以及遗传型FTLD-TDP A C9orf72中的存在和表达情况。我们试图确定在具有TDP-43病理的FTLD病例中，hnRNP是否在蛋白质和转录本水平上表现出异常表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。