唐氏综合征-阿尔茨海默病脑内APOE丰度升高与APP及C端片段丰度增加相关
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件,聚焦唐氏综合征-阿尔茨海默病(DSAD)与早发型阿尔茨海默病及健康对照的额叶皮层蛋白质组比较,并基于同一批样本开展单核RNA测序

基本信息
资源简介
唐氏综合征-阿尔茨海默病脑内APOE丰度升高与APP及C端片段丰度增加相关
Increased APOE abundance in the brain in Down syndrome - Alzheimer’s disease compared with early onset-Alzheimer's disease is associated with elevated APP and C- terminal fragment abundance
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件,聚焦唐氏综合征-阿尔茨海默病(DSAD)与早发型阿尔茨海默病及健康对照的额叶皮层蛋白质组比较,并基于同一批样本开展单核RNA测序。数据可用于分析21号染色体编码蛋白及APOE、APP等关键AD相关蛋白的丰度变化,探索不同细胞类型对蛋白质丰度改变的贡献,支持神经退行性疾病分子机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):21号染色体三体是唐氏综合征(DS)的病因,也是阿尔茨海默病(AD)最常见的遗传病因。在此,我们比较了唐氏综合征-阿尔茨海默病(DSAD)患者额叶皮层的蛋白质组与人口学匹配的早发型AD病例及来自一般人群的健康衰老对照。我们发现,与两个比较组相比,DSAD中多种21号染色体编码蛋白的丰度增加。此外,与匹配的早发型AD病例相比,DSAD患者中21号染色体编码蛋白之外的蛋白质组更广泛失调,包括关键AD蛋白APOE丰度的增加。为了解可能促成这些蛋白质丰度变化的细胞类型,我们对相同病例进行了单核RNA测序研究。这表明21号染色体三体
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284141
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 30 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
21号染色体三体是唐氏综合征(DS)的病因,也是阿尔茨海默病(AD)最常见的遗传原因。在此,我们比较了唐氏综合征-阿尔茨海默病(DSAD)患者额叶皮质的蛋白质组,并与人口学特征匹配的早发性AD病例及来自一般人群的健康衰老对照进行比较。我们发现,与两个对照群体相比,DSAD中多种由21号染色体编码的蛋白质丰度升高。此外,蛋白质组的广泛失调不仅限于21号染色体编码的蛋白质,还包括与匹配的早发性AD病例相比,DSAD患者中关键AD蛋白APOE的丰度增加。为了解可能参与这些蛋白质丰度变化的细胞类型,我们对相同病例进行了单核RNA测序研究。结果表明,21号染色体三体改变了多种细胞类型中这些蛋白质的转录。具体而言,APOE表达在星形胶质细胞、内皮细胞和周细胞的亚型中升高。
在我们的病例系列中,我们还发现APOE的丰度与全长APP及C端片段-α的丰度相关,但与淀粉样蛋白-β(AD斑块病理的关键成分)无关。APOE丰度增加可能影响DSAD患者大脑中AD病理的发展或对其的反应,改变疾病机制,具有临床意义。总体而言,这些数据强调,21三体在AD背景下改变了DS患者的转录组和蛋白质组,在为这一高风险早发性痴呆的重要群体选择治疗策略时,应考虑这些差异。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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