空间转录组学揭示阿尔茨海默病小鼠模型脑节律基因表达的区域性紊乱

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE282203

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数据说明

阿尔茨海默病（AD）是一种进行性神经退行性疾病，会损害记忆、认知功能以及执行日常活动的能力。除认知功能下降外，睡眠-觉醒周期的行为紊乱也是AD的标志性特征，包括睡眠逐渐碎片化、总睡眠时间减少以及傍晚时分意识混乱或烦躁不安加重（日落综合征）。新出现的证据表明，睡眠和行为的这些紊乱可能由昼夜节律时钟的分子失调所 underlying。本研究利用Visium空间转录组学，对APP23转基因小鼠（一种AD模型）及其非转基因同窝对照小鼠在7月龄和14月龄时多个脑区的昼夜转录节律进行了表征。我们揭示了APP23-TG小鼠节律性基因表达的显著改变，尤其在海马和皮层中。这些变化在7月龄动物中即已显现，与早期淀粉样蛋白沉积相吻合，并随着病理进展而持续存在。

本研究为阿尔茨海默病(AD)中节律基因表达的大规模失调提供了新的见解，揭示了与该疾病不同阶段昼夜节律紊乱相关的分子通路。它强调了这些紊乱在AD进展中的潜在作用，并为诊断、治疗和管理开辟了新途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。