GSE280268：追踪衰老、阿尔茨海默病与路易体痴呆共享分子特征的人脑图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280268

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

衰老通常表现为因不同类型痴呆的发病而导致的认知能力逐渐丧失。其中，阿尔茨海默病（AD）和路易体痴呆（LBD）是最为普遍的类型。然而，人们对于这些疾病之间的共同特征以及这些特征如何与衰老本身相关联知之甚少。本研究旨在识别一条可能将衰老与不同痴呆联系起来的分子主线，以期突出新型治疗策略的潜在靶点。我们对来自Abbiategrasso脑库（ABB）的脑样本进行了全转录组分析和基因集富集分析（GSEA），样本包括经神经病理学诊断为AD和LBD的受试者（每种病理6例）以及3例年龄匹配的无痴呆对照者（CTRLs）的海马（HI）、颞叶和顶叶皮层（TC、PC）、扣带回皮层（CG）和黑质（SN）。临床和神经心理学特征通过基线及随后数年进行的系列评估获得。

根据ABB协议，神经病理学诊断基于完整的组织学特征描述，包括所有主要的蛋白质病变和血管评分。转录组结果显示，两种病理在差异表达基因（DEGs）数量上存在一些主要差异，尤其是AD大脑的基因表达比LBD受到更大影响（DEGsAD=3156；DEGsLBD=278）。此外，GSEA显示，在AD中可以通过生物学过程对分析区域进行聚类（HI和TC：DEGs主要与突触传递相关；PC、CG和SN：DEGs主要与正确的蛋白质折叠和炎症相关），而在LBD中，仅SN（DEGs主要与正确的蛋白质折叠和炎症相关）和PC（DEGs主要与髓鞘形成和胶质系统激活相关）存在强烈而独特的受累。AD和LBD是不同形式的d

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。