ApoE4破坏改进型iPSC人脑内皮细胞模型中的胞内运输与铁稳态 [scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280214

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑内皮细胞中的转铁蛋白受体可通过跨血脑屏障的转胞吞作用将治疗性抗体递送至大脑。在阿尔茨海默病中，该受体转运是否仍保持完整，仍是一个重大的未解问题。在此，我们研究了阿尔茨海默病的主要遗传风险因子载脂蛋白E4（ApoE4）是否会改变人脑内皮细胞中的细胞内转运。为此，我们首先开发了一种基于明确化学成分组合和细胞外基质支持的诱导多能干细胞优化方案，用以分化脑内皮细胞（iCE-BECs）。多组学分析和功能性转运实验表明，iCE-BECs具有脑内皮基因特征，并再现了针对转铁蛋白受体的临床验证BrainshuttleTM抗体的受体介导转胞吞作用。经工程改造的ApoE4纯合iCE-BECs表现出早期内体时空组织改变、转铁蛋白受体表达增加以及细胞质铁减少。我们的数据揭示，ApoE4能够以细胞自主的方式影响血脑屏障的细胞内转运和铁稳态。

这一发现可能对阿尔茨海默病治疗性抗体的脑内递送具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。