NAD+与EVA1-C依赖的神经功能缺陷逆转由tau病变动物模型中差异可变RNA剪接介导

该数据集来自NCBI GEO,聚焦NAD+代谢、可变剪接事件与阿尔茨海默病及tau病变的关系。研究结合深度学习AI算法预测蛋白结构和蛋白互作,并使用hTau.P301S转基因小鼠与转基因hTau[P301L]秀丽隐杆线虫等tau病变模型,挖掘小鼠转录组数据以检测NAD+前体烟酰胺存在下差异诱导的可变

geo
浏览 9
基因组预测GPL2424710090
GSE279334: NAD+ - and EVA1-C-dependent reversal of neurological deficits is mediated by differential alternative RNA splicing in tauopathic animal models

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

NAD+与EVA1-C依赖的神经功能缺陷逆转由tau病变动物模型中差异可变RNA剪接介导

NAD+ - and EVA1-C-dependent reversal of neurological deficits is mediated by differential alternative RNA splicing in tauopathic animal models

该数据集来自NCBI GEO,聚焦NAD+代谢、可变剪接事件与阿尔茨海默病及tau病变的关系。研究结合深度学习AI算法预测蛋白结构和蛋白互作,并使用hTau.P301S转基因小鼠与转基因hTau[P301L]秀丽隐杆线虫等tau病变模型,挖掘小鼠转录组数据以检测NAD+前体烟酰胺存在下差异诱导的可变剪接事件。数据可用于探索NAD+依赖的可变剪接调控机制及神经功能缺陷逆转的分子基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):异常可变剪接事件(ASEs)正成为衰老的新标志,并与阿尔茨海默病(AD)等年龄相关神经退行性病理有关。AD大脑的特征是丰富的细胞内蛋白样聚集体,包括神经原纤维缠结(NFTs)。尽管NAD+及相关代谢物可以减缓AD进展,但NAD+对AD中ASEs的影响仍不清楚。本研究使用基于深度学习的AI算法预测蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用,以及包括hTau.P301S转基因小鼠和转基因hTau[P301L]秀丽隐杆线虫在内的实验性tau病变模型,研究NAD+代谢、ASEs与AD或AD样病理(包括tau病变)之间的关系。挖掘小鼠转录组数据以检测在NAD+前体烟酰胺存在下差异诱导的ASEs。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279334

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 18 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279334

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

异常可变剪接事件(ASEs)正逐渐成为衰老的一个新标志,并与阿尔茨海默病(AD)等年龄相关神经退行性病理相关联。AD大脑的特征是存在大量细胞内蛋白质聚集体,包括神经原纤维缠结(NFTs)。尽管NAD+及相关代谢物可以减缓AD进展,但NAD+对AD中ASEs的影响仍不清楚。本研究利用基于深度学习的AI算法预测蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用,并结合包括hTau.P301S转基因小鼠和转基因hTau[P301L]秀丽隐杆线虫在内的实验性tau蛋白病模型,探讨NAD+代谢、ASEs与AD或AD样病理(包括tau蛋白病)之间的关系。研究人员挖掘小鼠转录组数据,以检测在NAD+前体烟酰胺核糖(NR)存在下差异诱导的ASEs,并特别关注Eva1-C位点。结果显示,Eva1-C异构体的相对丰度对NR浓度和tau蛋白病基因型均敏感。

NAD+丰度/代谢状态调节ASEs以及EVA1-C异构体的表达,后者反过来调控与关键蛋白BAG-1和HSP70的相互作用,这些蛋白参与协调蛋白质稳态。重要的是,与20例认知正常人类相比,20例Braak 5/6期AD患者死后内嗅皮层和海马神经元中EVA1-C显著减少。因此,本研究支持这一新观点:NAD+代谢调节特定mRNA异构体的丰度,且ASEs影响模型tau蛋白病以及潜在AD的疾病进展。这些结果可促进未来开发基于NAD+的AD剪接转换治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案