线粒体DNA与亚细胞RNA错位是神经退行性痴呆的趋同机制并可被VCP ATPase抑制挽救
研究对健康个体与家族性阿尔茨海默病及额颞叶痴呆患者来源的人iPSC衍生皮层神经元进行核与胞质组分的转录组范围分析,评估mRNA核质定位,揭示AD和FTD突变诱导mRNA核质分布显著改变,并发现线粒体相关转录本在不同突变间重新分布及线粒体RNA向胞质显著泄漏

基本信息
资源简介
线粒体DNA与亚细胞RNA错位是神经退行性痴呆的趋同机制并可被VCP ATPase抑制挽救
Mislocalization of mitochondrial DNA and subcellular RNA is a convergent mechanism in neurodegenerative dementias and is rescued by VCP ATPase inhibition
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE277599_series_matrix.txt.gz,主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台GPL24676。研究对健康个体与家族性阿尔茨海默病及额颞叶痴呆患者来源的人iPSC衍生皮层神经元进行核与胞质组分的转录组范围分析,评估mRNA核质定位,揭示AD和FTD突变诱导mRNA核质分布显著改变,并发现线粒体相关转录本在不同突变间重新分布及线粒体RNA向胞质显著泄漏。数据可用于研究神经退行性痴呆中核质运输缺陷与亚细胞RNA定位机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 19 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在阿尔茨海默病(AD)和额颞叶痴呆(FTD)中已观察到核质运输缺陷。然而,很少有系统性的工作来评估这些条件下转录组范围的亚细胞mRNA分布,如果失调可能会严重损害细胞稳态。在这里,我们通过对来自健康个体与家族性AD和FTD患者的人iPSC衍生皮层神经元的核和胞质组分进行转录组范围分析,评估了mRNA核质定位。我们的发现揭示AD和FTD突变诱导mRNA核质分布的显著变化。我们还揭示了线粒体相关转录本在不同突变间的重新分布。在AD和FTD突变神经元中,线粒体RNA(mtRNA)向胞质的显著“泄漏”m
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277599
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 28 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
在阿尔茨海默病(AD)和额颞叶痴呆(FTD)中已观察到核质运输缺陷。然而,针对这些疾病状态下转录组范围的亚细胞mRNA分布进行系统性评估的研究尚少,若该分布失调,可能严重损害细胞稳态。本研究通过对比健康个体与家族性AD及FTD患者来源的人iPSC衍生皮层神经元的核与胞质组分,开展转录组范围分析,以评估mRNA的核质定位。研究发现,AD和FTD突变诱导mRNA核质分布发生显著变化。我们还揭示了线粒体相关转录本在不同突变间的重新分布。AD和FTD突变神经元中线粒体RNA(mtRNA)显著“泄漏”至胞质,促使我们进一步检测mtDNA的泄漏情况。重要的是,我们发现AD和FTD皮层神经元中mtDNA异常胞质累积,且使用VCP D2 ATPase结构域的药理学抑制剂治疗可逆转这一现象。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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