抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)对阿尔茨海默病(AD)小鼠模型空间转录组的影响
该数据集来自NCBI GEO,研究硬脂酰辅酶A去饱和酶抑制剂(SCDi)对小鼠脑空间转录组的影响。实验将野生型和3xTg-AD雌性小鼠经脑左侧脑室输注对照(DMSO)或SCDi共28天,第31天取脑并按10x Genomics Visium空间基因表达方案建库测序

基本信息
资源简介
抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)对阿尔茨海默病(AD)小鼠模型空间转录组的影响
Effects of inhibiting stearoyl-CoA desaturase (SCD) on the spatial transcriptome in a mouse model of Alzheimer's disease (AD)
该数据集来自NCBI GEO,研究硬脂酰辅酶A去饱和酶抑制剂(SCDi)对小鼠脑空间转录组的影响。实验将野生型和3xTg-AD雌性小鼠经脑左侧脑室输注对照(DMSO)或SCDi共28天,第31天取脑并按10x Genomics Visium空间基因表达方案建库测序。数据可用于分析SCD抑制在AD模型中的空间转录组响应,涉及神经系统疾病与阿尔茨海默病研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 19 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究探讨了硬脂酰辅酶A去饱和酶抑制剂(SCDi)对小鼠脑空间转录组的影响。更具体地说,在植入用于皮层脑电图和肌电图的电极后,将野生型和3xTg-AD雌性小鼠经脑左侧脑室输注对照(DMSO)或SCDi,持续28天。在治疗开始后第31天早晨取样脑组织并立即冷冻。脑组织按10x Genomics的Visium空间基因表达方案进行处理和文库构建。测序由Genome Quebec(加拿大魁北克省蒙特利尔)完成。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275131
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 23 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
本研究探讨了硬脂酰辅酶A去饱和酶抑制剂(SCDi)对小鼠脑空间转录组的影响。更确切地说,将野生型和3xTg-AD雌性小鼠在脑左侧脑室灌注对照溶剂(DMSO)或SCDi,持续28天(在植入用于皮层脑电图和肌电图的电极之后)。在治疗开始后第31天上午采集脑组织样本,并立即冷冻。按照10x Genomics的Visium空间基因表达方案对脑组织进行处理并构建文库。测序由Genome Quebec(加拿大魁北克省蒙特利尔)完成。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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