阿尔茨海默病中的小胶质细胞克隆性炎症性疾病 [dataset 2]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274036

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

由合子后DNA突变引起的体细胞遗传异质性在人体组织中普遍存在，并可能导致疾病，然而很少有研究探讨其在阿尔茨海默病（AD）等神经退行性过程中的作用。在此，我们报告，与年龄匹配的对照组相比，AD患者中选择性富集了携带致病性变异的小胶质细胞克隆，而这些变异不存在于神经元、胶质/基质细胞或血液中。值得注意的是，小胶质细胞特异性的AD相关变异优先靶向MAPK通路，包括反复出现的CBL环域突变。这些变异在体外和患者中均激活ERK并驱动以强烈神经炎症反应为特征的小胶质细胞转录程序。尽管AD相关小胶质细胞克隆的自然史在人类中难以确定，但先前已证明小胶质细胞表达MAPK通路激活变异可在小鼠中引起神经退行性变，提示AD相关神经炎症性小胶质细胞克隆可能促进患者的神经退行性过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。