阿尔茨海默病中的小胶质细胞克隆性炎症性疾病数据集1
源站描述指出,研究报道了 AD 患者小胶质细胞中携带致病性变异的克隆选择性富集,这些变异偏好靶向 MAPK 通路,包括复发性 CBL 环域突变,可激活 ERK 并驱动神经炎症转录程序
![GSE274035: A microglia clonal inflammatory disorder in Alzheimer’s Disease [dataset 1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/78775.jpg)
基本信息
资源简介
阿尔茨海默病中的小胶质细胞克隆性炎症性疾病数据集1
A microglia clonal inflammatory disorder in Alzheimer’s Disease [dataset 1]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为“A microglia clonal inflammatory disorder in Alzheimer’s Disease [dataset 1]”,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类。数据包含 1 个文件 GSE274035_series_matrix.txt.gz,基于高通量测序表达谱,平台 GPL24676,物种 9606。源站描述指出,研究报道了 AD 患者小胶质细胞中携带致病性变异的克隆选择性富集,这些变异偏好靶向 MAPK 通路,包括复发性 CBL 环域突变,可激活 ERK 并驱动神经炎症转录程序。该数据可用于探索 AD 相关小胶质细胞克隆的分子特征与分类(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 05 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):由合子后 DNA 突变引起的体细胞遗传异质性在人体组织中广泛存在,并可能导致疾病,然而很少有研究调查其在阿尔茨海默病(AD)等神经退行性过程中的作用。在此,我们报告,与年龄匹配的对照相比,AD 患者的小胶质细胞克隆携带致病性变异的选择性富集,这些变异不存在于神经元、胶质/基质细胞或血液中。值得注意的是,小胶质细胞特异性的 AD 相关变异优先靶向 MAPK 通路,包括复发性 CBL 环域突变。这些变异激活 ERK,并在体外和患者中驱动以强烈神经炎症反应为特征的小胶质细胞转录程序。尽管 AD 相关小胶质细胞克隆的自然史在人类中难以确定,但 MAPK 通路激活的小胶质细胞表达
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274035
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 19 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
由合子后DNA突变引起的体细胞遗传异质性在人体组织中普遍存在,并可能导致疾病,然而很少有研究探讨其在阿尔茨海默病(AD)等神经退行性过程中的作用。在此,我们报告,与年龄匹配的对照组相比,AD患者中选择性富集了携带致病性变异的小胶质细胞克隆,而这些变异不存在于神经元、胶质/基质细胞或血液中。值得注意的是,小胶质细胞特异性的AD相关变异优先靶向MAPK通路,包括反复出现的CBL环域突变。这些变异在体外和患者中均激活ERK并驱动以强烈神经炎症反应为特征的小胶质细胞转录程序。尽管AD相关小胶质细胞克隆的自然史在人类中难以确定,但先前已证明小胶质细胞表达MAPK通路激活变异可在小鼠中引起神经退行性变,提示AD相关神经炎症性小胶质细胞克隆可能促进患者的神经退行性过程。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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